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借呗已经还款了，但仍然收到还款通知短信，可能存在以下几种情况。
1、延迟通知：银行或金融机构的系统可能会有一些延迟，导致已经还款的信息未能及时同步，所以发送了还款通知。
2、系统出错：有时候系统会出现错误，错误地发送了还款通知。
3、误操作：可能用户在进行某些操作时误触发了还款通知。
4、第三方机构通知：可能借呗的还款通知是由第三方机构代为发送的，这些机构有时会出现消息同步不及时的情况。
为了确认是否已经成功还款并避免不必要的困扰，可以采取以下措施：
1、登录支付宝或相关金融APP，查看借款和还款记录，确认是否已经还款。
2、联系借呗的客服，确认还款情况并询问关于短信的原因。
3、如果确认已经还款并确定是多余的短信通知，可以忽略它或者回复短信确认已经还款。
如果出现任何异常或不确定的情况，建议及时联系借呗的客服或相关金融机构以获取帮助。